總統裁示：於農業部設置常設性的動物保護會
總統府於2014年1月29日，發出1月10日在總統府舉辦的「總統與動保團體座談會」正式會議紀錄。紀錄中針對討論如何強化動保行政能量的議題，馬總統裁示在行政院組織再造後，將規劃設置常設性的動物保護會，並發表了對未來動保會設立的期許！
關於動保團體提出意見，期待我國動保行政組織能避免產業掛帥，成立動物保護專責機構。馬總統明確回應表示，未來農委會成為農業部後，將設立「動物保護會」，部長將擔任常設性動物保護會的召集人，內部可直接指揮協調，進行有效部會協商。雖然此「動物保護會」仍在農業部之下，但卻是直接隸屬與農業部部長，不像當前的編製，動保科是隸屬於畜牧處之下。如此編制應該比設置一個獨立的動物保護局，更能夠發揮動物保護的行政效能。因為若在行政院下新創設一個獨立的動物保護局，目前台灣動保理念尚未鞏固、動保專業人才培育體系也尚未建構完善，新創設的動物保護局很容易因為規模、層級以及協調力不足，而淪為弱勢的「局」，失去與農畜產業相關部門相抗衡的力量，反而無法達到強化動保行政能量的目標。
同時，在地方上，總統也建議各地縣市，應該設立「動保會」的對口單位，並且可以比照現行「治安會報」機制，每兩三個月定期召開會議，由地方首長親自主持，而中央扮演督導角色，考核地方政府成效並對外公布，希望這樣的機制可有效促使地方首長重視動物保護議題。
座談會當天，農委會陳主委陪同總統出席，動物保護會的設置是繼陳主委於2012年底正式表示將成立動保會後，再度獲得總統肯定確認，期待行政院組織再造後，農業部成立，「動物保護會」也能迅速到位，為台灣動物保護開啟新頁。