1.效率低落而缺乏人道的捕犬方式
雖然政府已經花費很多經費在捕犬問題上，可是捕犬的成效仍然非常低落，因為公務人員效率低落，我們花費了驚人預算在捕犬人員身上，可是民眾還是很容易在街上看到流浪動物，而且捕犬的不人道問題不斷地被媒體報導揭發，可見政府根本沒有能力好好管理這些捕犬人員，這些捕犬人員普遍素質低落且缺乏動物福利意識，難以管理所以問題叢生，以台北市為例，光是捕犬
隊捉一隻狗，成本就要超過三千元，而且臺北市還是很容易見到流浪狗，可見這是一個成本驚人，而且成效不彰的作業方式。
2.難以管理且問題叢生的公立收容所
公立收容所由於不人道的流浪動物處理方式，處死許多且個性良好的流浪動物，以致難以招募真正愛護動物且適任的收容所管理人員，連設計犬舍及作業流程的「專家」，都嚴重的缺乏犬舍管理的知識，而犬舍管理人員素質更是驚人低落，面對許多嚴重犬舍問題而視而不見，甚至以為理所當然。政府當局面對犬舍問題不斷被揭發，總是以「個案」視之，如花蓮吉安鄉91年春節狗吃狗事件，僅僅懲處數人草草了事，事實上因為政策問題導致收容所人員問題普遍存在，而且難以解決。
3.難以解決的收容所疾病防治問題
犬隻有很多疾病，如犬瘟熱、犬舍咳，是如同SARS一樣的可怕，連一流大醫院都很難控制的疾病你如何期望公立收容所能做的更好。
4.難以提高的認養率
公立收容所普遍位置不佳，認養率低落，就算號稱40%「認領養」率的台北市，可能有30%的「領回」，剩下10%的大多是幼犬，成犬99%死路一條，台北市還號稱「認領養」全國第一，認養率都如此低落，那其他收容所可想而知。
一昧照抄國外安樂死的流程，造成許多嚴重的問題，國外的安樂死流程，是在動物與管理人員互動良好的前提下進行的，反觀國內的安樂死，動物與管理人員幾乎沒有互動，如何能夠不驚嚇到這些動物，而拒絕讓民眾監督，更加重了問題的嚴重性。
5.低落的絕育比例
台灣的犬隻絕育比例偏低，但犬隻管制卻不確實，以至於有生育能力的卻疏縱在外的犬隻比例過高，製造流浪動物問題。然而我們的政府當局卻一味的採取撲殺政策，卻不知絕育才是人道解決流浪動物問題的根源。為有從來源下手，才能真正解決流浪動物問題。